Project information
Telomeric chromatin in plants influenced by epigenetic drugs

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
LTC17077
Project Period
6/2017 - 2/2019
Investor / Pogramme / Project type
Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology

Rostliny představují důležité modelové systémy pro epigenetické studie i biologii telomer, protože v obou těchto oblastech byly popsány jejich specifické vlastnosti. Telomerová DNA většiny rostlin je tvořena sekvencí TTTAGGG, která byla identifikována v rostlině Arabidopsis thaliana. Mezi výjimky patří rostlina Cestrum elegans, jejíž telomery jsou tvořeny repetitivní sekvencí TTTTTTAGGG. Telomery, jakožto klasické chromatinové struktury, podléhají epigenetickým regulacím. U savčích modelů bylo prokázáno, že heterochromatinový charakter telomer je důležitý pro jejich stabilitu; v buňkách s nižší hladinou heterochromatinových značek na telomerových histonech dochází k prodloužení telomer a zvýšení jejich rekombinace, což může mít fatální důsledky pro stabilitu genomu. Rostlinný telomerový chromatin byl charakterizován jako duální, na pomezí mezi heterochromatinem a euchromatinem s převahou heterochromatinových modifikací histonů. Tyto analýzy byly prováděny na rostlinách A. thaliana a Nicotiana tabacum, zástupcích s klasickou telomerovou sekvencí TTTAGGG. V tomto projektu plánujeme navázat na předchozí výzkum a analyzovat epigenetické modifikace telomerových histonů v Cestrum elegans, rostlině s nekanonickou telomerovou sekvencí TTTTTTAGGG. Bude analyzován telomerový chromatin v listech a v kalusech, a v kalusech kultivovaných v přítomnosti epigeneticky aktivních látek. V kalusech bude dále testována délka telomer; epigeneticky aktivní látky zebularin a dihydroxypropyl adenin byly v předchozích studiích testovány na tabákové buněčné kultuře BY-2 a rostlinách A. thaliana a zatímco A. thalina klíčené v přítomnosti těchto hypomethylačních drog měly výrazně kratší telomery, délka telomer buněk BY-2 se nezměnila. Pro účely co nejpřesnější analýzy délky telomer bude optimalizována metoda TRF (terminal restriction fragments). Naše předběžné experimenty ukázaly, že telomerové histony A. thaliana a N. tabacum jsou acetylované, kalusy budou proto kultivované i v přítomnosti inhibitorů histon deacetyláz trichostatinu A a hydroxybutyrátu. Lze předpokládat, že data získaná během řešení projektu významným způsobem rozšíří poznatky o biologii rostlinných telomer.

Publications

Total number of publications: 2


You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.