Informace o projektu
Charakterizace regulačních mechanizmů sestřihu mRNA ve skrytých donorových místech sestřihu
- Kód projektu
- GF24-11219K
- Období řešení
- 4/2024 - 3/2027
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- LA granty
- Lead agentura
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Lékařská fakulta
- prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D.
- Mgr. Viktor Bíly
- Mgr. Michal Kramárek, Ph.D.
- Spolupracující organizace
-
National Institute of Chemistry
V posledních letech se ukázalo, že kryptická místa sestřihu mohou hrát důležitou roli při regulaci sestřihu RNA, a zprostředkovaně i celé genové exprese. Mnoho takových regulačních míst je třeba ještě objevit a prozkoumat mechanismy jejich působení. Tento projekt je zaměřen na tzv. decoy 5' sestřihová místa (d-5'ss). Ta obsahují konsenzuální sekvenci 5' sestřihových míst a umožňují sestavení spliceosomu. Budou zkoumány dva hypotetické způsoby jejich působení. Pokusíme se určit podíl d-5'ss, které sestavují neproduktivní spliceozomální komplexy, které soutěží s rozpoznáváním blízkých kanonických sestřihových míst a zpomalují jejich sestřih. Zadruhé určíme typy d-5'ss, které jsou štěpeny prostřednictvím sestřihové reakce, ale výsledná RNA je poté degradována. V poslední řadě budeme zkoumat vliv reprezentativních d-5'ss na dynamiku exprese a lokalizaci transkriptů produkovaných z odpovídajících genů během diferenciace neuronů.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.